翼王石达开带领太平军进入江西后，于1855年12月9日攻占新昌（今宜丰），12月18日攻占瑞州（今高安），12月19日攻占临江，1856年1月8日攻克袁州（今宜春），3月1日攻克吉安，3月28日占领抚州。

在这段时间，包括小刀会起义军在内的广东天地会起义军，接连投奔石达开，成了太平军中的&ldo;花旗&rdo;部队。

他们加入太平军后，壮大了太平军的力量，共同投入反对中外反动派的斗争，连战告捷，将湘军魁首曾国藩困于南昌，又分出部队由石达开带往天京，参与摧毁包围天京三年之久的清军江南大营，从而使太平天国前期的军事力量发展到最高峰，太平天国的一系列军事上的胜利，其中也有小刀会起义军余部的功劳。

还有一部分起义军，撤出上海县城后，退至嘉定真如镇与南翔镇一带坚持斗争。

起义军余部吴阿荣等人退到真如镇后，集结起一支数百人的队伍，称&ldo;三千帮&rdo;，当地士绅曾说：吴阿荣本系红头，曾在上海城中据守，后来漏网。

1860年6月，他们数人痛打引导外国军队来到镇上的通事，而被外国军队押往上海，加以迫害。

与此同时，太平军攻打上海，南翔一带的起义军余部立即起来斗争，配合太平军作战，7月1日，太平军攻陷松江城，7月15日，进攻七宝镇。

地主武装组织抵抗，太平军不久放弃松江北去。

诸翟镇的地主武装也来攻击太平军并攻剿南翔一带小刀会余部。

还有一部分小刀会员退出上海县城后，在浦江乡下隐藏起来，秘密从事反抗斗争，称浦东塘桥帮。

太平军进攻上海时，他们与太平军取得了联系，随即聚集数千农民，日夜赶制旗帜，准备起来配合太平军，因走漏了风声，遭到上海知县刘郇（xún）膏的镇压，还没起义即被扑灭。

还有一支小刀会起义军逃到了海上，他们成为一支力量很大的海上抗清武装队伍。

小刀会起义军中，有许多广东、福建沙船上的船夫，上海陷落前夕，他们实行转移，虽有伤亡，但不少人安全脱险。

起义军撤出上海县城后，也有一些小刀会员逃到了海上。

小刀会员到了海上，继续同清朝统治者斗争。

1855年4月11日，江苏、浙江运粮漕船，行到山东黑水洋石岛以南时，&ldo;被艇匪抢劫银米&rdo;，4月15日，有数十只装豆卫船被截。

清军官方禀报说：山东石岛、成山一带，广东盗贼很多，开始时骚扰南来卫船，每船索银1100两，随后抢截北上沙船，银、米都有损失，其他船只不敢前进，影响海运大局。

清朝统治者深感头疼，命令山东、江南以及盛京（今辽宁）等地大力增调兵力，严加防范，但仍无济于事。

从4月至7月，官船商船频繁被&ldo;盗船&rdo;、&ldo;盗艇&rdo;所劫。

据《大清历朝实录》记裁，这段时间官船被劫至少有八九次。

4月27日，有&ldo;匪船&rdo;5只，约三四百人，在即墨县之金口掳去官船5只，要求用银来赎；同日又在胶州地面，开放大炮，掳走两只船；再到青岛，开炮击毁几处清军住房，劫走几名水手，又劫获货船1只。

这使清廷感到震惊。

5月30日，在石岛（伉荣城）洋面，曾有几艘&ldo;盗船&rdo;企图攻占口岸，清守军开炮迎击，清军11艘船被轰毁。

第二天又来了1只&ldo;盗船&rdo;，配合前一天的船只来攻，清军凶猛的炮火，轰毁&ldo;盗船&rdo;1只，&ldo;盗船&rdo;才退却。

6月24日，突然有10余只&ldo;盗船&rdo;，随同商船一起，闯进没沟营口，然后开炮，劫掳商船，将所有进出船只截住，索要银两。

直到7月10日，&ldo;盗船&rdo;才退出海口。

没沟营口商船云集，税课攸关，清廷命令当地将官，设法堵剿，严密防范。

7月13日，&ldo;盗船&rdo;又驶回没沟营口，后又窜入复州（今属辽宁瓦房店

市）娘娘宫海口，登岸袭击清军，并将清军战船围截烧毁。

7月23日，又有&ldo;盗艇&rdo;32只，驶至金州（今辽宁金县）羊头洼口，直扑岸边，经清军轰击，几名&ldo;盗匪&rdo;被击毙，&ldo;盗艇&rdo;仍盘踞营口。

清廷命令清军官兵严守口岸，并到山海关、奉天处洋面，攻剿&ldo;匪艇&rdo;。

7月16日，有南来的&ldo;盗艇&rdo;三四十只，占踞石岛口门。

7月18日，&ldo;有盗船十七只&rdo;，进入即墨县金家口外香岛停泊。

清廷怕这些&ldo;盗船&rdo;声东击西，命盛京、直隶、山东沿海等地严加防堵，又令怡良等再派水师赴山东协办攻剿。

这些&ldo;盗船&rdo;、&ldo;盗艇&rdo;是属于上海小刀会余部的，他们活跃在山东、直隶，盛京等地沿海的广阔海面上，活动范围广泛，机动灵活。

他们截留官府船只，夺取漕粮银两，烧毁敌人兵船，给清朝漕运造成严重的威胁。