为了巩固和扩大泸州起义的成果，杨闇公、朱德、刘伯承于1927年1月中旬在万县开了军委会会议，分析研究了当前的局势与发展趋势，商讨了控制泸州的方案。

最后决定：由刘伯承即刻到泸州，全权指挥泸州起义军。

1月下旬，刘伯承赶到了泸州城。

针对起义军内部涣散不统一的状况，他采取了果断有力的措施，全面进行整顿。

他颁布了《国民革命军川军各路总指挥部布告》：&ldo;为布告事，照得本总指挥奉命整顿本军各路部队，现已到达泸城，从事整理一切，除分别呈令外，合行布告军民一体知照，此布。

总指挥刘伯承。

&rdo;印刷后广为张贴。

他在原泸县道署建立总指挥部，使泸州城的军政财务大权，高度集中，统一指挥。

为融洽各路司令，定每日午后，在道署内集体办公。

大批任用共产党员和左派人士，以带动和影响整个起义军。

2月中旬，在校场坝举行的大会上，他到会作重要讲话，庄严宣布总指挥部成立，号召大家团结一心，彻底革命，&ldo;决不挂羊头卖狗肉&rdo;，&ldo;要搞三民主义，不能不要民生主义，而搞二民主义&rdo;。

同时，陈兰亭、袁品文、皮光泽宣布就任国民革命军第四、五、六路司令。

中共中央、重庆地委先后派出的政治工作人员陆续到达泸州。

刘伯承将他们分派到各起义部队。

第四、五、六路设政治部、党代表，各团设政治指导员，绝大多数由共产党担任。

总指挥部明确规定：部队对上对下公文，须经政工人员签署，方为有效。

1927年2月25日《国民公报》报道：&ldo;刘总指挥对陈、袁、皮三部政治工作极为注意，除由政治部进行外，本人随时监督。

&rdo;刘伯承深入起义军各部进行检阅，检查部队素质，督促训练等各项工作，准备迎接新的斗争。

为着培训基层官佐和革命骨干，刘伯承还积极筹办军事政治学校，亲自兼任校长，由共产党员和左派人士充任教员。

泸州本是川南重要商埠，每月单盐税一项就达8万元之巨。

李章甫占据泸城以后，百般搜刮，弄得民穷财尽，百业凋蔽，钱粮款项早已预征到1931年。

加上泸城兵满为患，更使民众负担倍增。

起义爆发，双方交战，又给财政带来新的困难。

各部所需军费往往不如实上报，互相之间分派不均，义引起重重矛盾。

不良分子乘机从中贪污作弊，制造混乱。