漠西蒙古的前身，是明朝时赫赫有名的瓦剌部。

土木堡之变后，瓦剌势力日益衰落，部分瓦剌部族西迁中亚一带，也有部分迁入青海地区。

到明末的时候，瓦剌分裂成杜尔伯特、准噶尔、土尔扈特、和硕特四部，其中尤以准噶尔实力最强。

公元1640年，在新疆塔尔巴哈，准噶尔部首领巴图尔召集漠西蒙古各部，颁布了《卫拉特法典》，这部法典划分了漠西蒙古各部落的游牧范围以及各项法律。

从此以后，准噶尔汗国俨然以漠西蒙古领袖的身份壮大起来，和硕特部被排挤到青海地区，土尔扈特西迁到中亚，杜尔伯特臣服于准噶尔。

巴图尔统治时期准噶尔的势力范围，包括今天的巴拉喀什湖东段、吐鲁番地区，首府为今天新疆北部的博赛列地区。

与其他游牧民族政权不同的是，准噶尔部不仅游牧业发达，南部还出现了农业与城市。

此时，俄罗斯帝国的势力也渗透入中国西北地区，在公元1640年十月，巴图尔就曾与俄罗斯打过交道。

当时俄罗斯的探险队进入准噶尔地区，屠杀准噶尔部居民，巴图尔坚决反击，不但击退了俄罗斯探险队，还派使节警告俄罗斯。

从公元1640年到1647年，准噶尔部与俄罗斯在边境上发生了13次摩擦，其强硬的态度令俄罗斯使臣感慨说&ldo;这将是帝国东进最大的一块石头&rdo;。

如果没有准噶尔的存在，沙皇俄国侵略中国新疆，恐怕会容易得多。

公元1653年巴图尔去世后，其子僧格即位。

公元1670年，僧格被异母兄弟暗杀，准噶尔部陷入内乱。

巴图尔一个在西藏出家的儿子，返回准噶尔夺取了政权，他就是大名鼎鼎的葛尔丹。

葛尔丹生于公元1644年，他出生的时候，阿尔泰山上空出现了五彩祥云，令巴图尔大为欣喜，随后葛尔丹被送到拉萨出家，与五世达赖成了好友，还和藏王第巴桑结嘉错是同学。

政变发生后，葛尔丹本无意争夺可汗位，只愿在西藏研究佛学，其母去西藏劝说，让葛尔丹动心。

葛尔丹离开西藏前，五世达赖授予葛尔丹&ldo;博硕克图&rdo;的称号，这也成为后来葛尔丹拉拢蒙古部落的一个招牌。

公元1671年，葛尔丹击败反对派，成功登上准噶尔可汗的宝座。

这以后，就是准噶尔汗国的一段征服史：他先利用自己与达赖喇嘛的关系，劝说卫拉特其他部落归顺自己。

同时还四处征伐，打击的目标首先对准了东迁青海的和硕特部。

公元1677年，葛尔丹发动进攻，击败和硕特部，获得胜利后，又采取怀柔政策，招降了和硕特部的车臣可汗。

夺取和硕部是准噶尔汗国的重要一步：和硕部一直是瓦剌四部中的&ldo;盟主&rdo;，此时的瓦剌四部，除了土尔扈特西迁外，其他3部已尽被准噶尔吞并。

公元1680年，葛尔丹颁布法令，取消了原本松散的瓦剌联盟，解除了明清两个王朝曾册封各部落的所有封号，建立了他自己的独立王国‐‐准噶尔汗国。

公元1680年，葛尔丹发动西征，灭亡了天山南路的叶尔羌汗国。

至此，葛尔丹已经完全建立了他在西北一统天下的地位。