反对这次远征以及心存疑虑的远征军军官大有人在，因此半官方的报纸《箴言报》在4月1日发表的一篇文章上险些泄露了天机，该文称一次&ldo;兼有社会和军事性质的远征&rdo;正在成行，&ldo;其目的地是埃及。

通过埃及进逼英国殖民地印度，要在那里打击英国。

&rdo;与此同时，大部分拿破仑的军官，甚至连政府的高级官员都仍然被蒙在鼓里。

为了弥补这一破绽，并进一步迷惑英国人，4月4日，《箴言报》上刊登了政府公告，称：&ldo;拿破仑将军将在10天内启程到布雷斯特担任英格兰方面军指挥官。

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海军舰队和护卫队显然没有能够按照命令在4月9日出发。

在海上执行任务一年多的布吕埃斯的舰队已经离开科浮岛，但是还没有到达。

此外，大部分军舰在经过数月的海上航行之后，都需要维修并对大量减员进行补充。

尽管如此，当由6艘法国军舰、5艘威尼斯战船和9艘三桅快舰（其中6艘是法国的）组成的破烂舰队终于于4月2日在土伦抛锚停泊时，布吕埃斯仍然受到了热烈的欢迎。

然而，布吕埃斯和他的舰队所受到的欢迎是短暂的。

离家一年多的布吕埃斯刚刚登岸便接到拿破仑和军事委员会的命令：他所指挥的舰队经过补给和载兵之后，必须向未知的目的港，&ldo;立即起航不得延误&rdo;。

雪上加霜的是，委员会还通知布吕埃斯，由于海军经费空虚，无力支付他拖欠舰队9个月的军饷！

海军中将不顾坐镇巴黎的那些人的决定，坚持舰队需要修整的时间；更有甚者，舰队将补充在沿海强征入伍的士兵。

这当然意味着大量未经训练的水手将进行这次远征，尽管有命令&ldo;尽量限制外国人&rdo;入伍也于事无补。

此外，布吕埃斯还做出了非同寻常的决定：清除不称职和不服从命令的海军军官，包括5艘军舰的舰长。

还有，布吕埃斯拒绝接受3个月的修整期，坚持要经过6个月的修整之后才能出海征战。

训练成千上万强征入伍的水兵是一件麻烦的事。

舰队的纪律必须得到维持，布吕埃斯据理力争，现有的对整个舰队中普遍存在的不服从军纪的军官和水兵的惩罚条例过于宽松。

革命中诞生的军事法庭陪审团制度应予以取消，应赋予舰长更大的权力，&ldo;包括在战争中有权对怯弱者处死的权力&rdo;。

至于临阵逃脱的水兵，必须&ldo;就地予以正法&rdo;。

对动摇军心者更应严惩不贷。

&ldo;我们面对着舰只数量3倍于我们的强大而训练有素的敌人，&rdo;他用非常逆耳的语言对巴黎的海军领导总结道，&ldo;我们打算进行的战役，对我们是有决定性的。