久已厌倦政治的顾宪成，退出&ldo;江湖&rdo;，还是身不由己，不得不出面为挚友李三才辨白。

他写信给内阁首辅叶向高、吏部尚书孙丕扬，说：&ldo;三才至廉至淡漠，勤学力行，为古淳儒，当行勘以服诸臣心&rdo;，希望叶向高、孙丕扬能够查明真相，秉公处理，还李三才一个清白。

这完全是一种私人行为，谈不上&ldo;遥执朝政&rdo;。

不料这些信件被刊登上邸报（政府公报），引起轩然大波。

那些攻击李三才&ldo;结党&rdo;的官僚，以为抓住了把柄－－东林书院&ldo;遥执朝政&rdo;。

这是顾宪成无论如何没有料到的。

他对李三才从相识到相知，对他的人品操守十分敬仰。

万历三十七年他在信中对李三才说，现在时局千难万难，只有才干卓识如你这样的人，&ldo;方有旋转之望&rdo;这是促使他写信给阁部大僚的缘由。

当然他也深知，由他这个在野的革职官员来议论此事，必然会遭到嫌疑。

事后他在给友人的信中谈到，他之所以这样做的原因，是钦佩李三才每当&ldo;风波汹涌之时，毅然出而挺身担荷&rdo;，&ldo;不肖独何心而忍默默&rdo;！

虽然他的言论必然会遭来麻烦，但他坦然得很，&ldo;聊以尽此一念而已&rdo;。

顾宪成这位桃花源中人实在是太书生气了。

以前在朝时他就特立独行，如今在野了，依然对政治斗争的险恶估计过低。

事态愈来愈扩大，对李三才和东林书院的攻击也愈来愈厉害。

这时他才意识到写这些信是失策的，在给朋友的信中无可奈何的说：&ldo;去岁救李淮抚（指李三才）书，委是出位&rdo;，为此深深悔恨；又说：&ldo;独弟血性未除，又于千古是非丛中添个话柄，岂非大痴！

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然而为时已晚。

政治斗争的险恶难以逆料，不但李三才陷入了危机，而且顾宪成与东林书院也受到牵连，一些别有用心者，把李三才与顾宪成联系起来，一并诬称为&ldo;东林党&rdo;。

始作俑者便是徐兆魁之流，他无中生有地说：&ldo;顾宪成讲学东林，遥执朝政，结淮抚李三才，倾动一时&rdo;，是非混淆，黑白颠倒，以至于此。

万历四十年五月，顾宪成在一片诽谤声中与世长辞。

顾宪成之死，触发正直人士为他辩护洗刷的激情，户部广东司主事李朴大声疾呼：&ldo;顾宪成也，久栖林壑，游心性命，即一书出而议及时事，可从则从，不可从则止，有何长鞭足以制人？乃满朝之人哄然四起，宛如敌国，不为&lso;遥制国是&rso;，则为&lso;不肖渊薮&rso;，且并讲学而非芍之。

&rdo;然而毕竟寡不敌众，李朴被整得狼狈不堪，落得个&ldo;调闲散用&rdo;的处分。

此后对东林书院的攻击愈演愈烈，污蔑它是&ldo;遥制国是&rdo;的&ldo;党&rdo;。