崇祯元年，崇祯皇帝大刀阔斧地清查阉党逆案，昔日遭魏忠贤迫害的官员纷纷起用，郑鄤也以翰林院庶士原官赴京履任。

不久，因父亲郑振先病故，辞官回乡丁忧守制，继而母亲吴太夫人病故，继续丁忧守制，直到崇祯八年才重回官场。

郑鄤退居林下之时，内阁中周延儒与温体仁互相倾轧，引起言官非议，郑鄤在公开场合倡言：周决不可用，而温实可人用，言官不应当各打五十大板。

与郑鄤同出于前阁臣钱龙锡门下的钱士升对这种说法十分欣赏，为讨好温体仁，极力向温体仁推荐郑鄤。

当时，文震孟已经进入内阁，处处受到内阁首辅温体仁的排挤，因此他劝郑鄤不要来京。

郑郧以为有阁臣钱士升推荐，内阁首辅温体仁提携，仕途一定有如坦途，欣欣然赴京履任。

殊不知他的族舅前任阁臣吴宗达早已在温体仁面前百般诋毁，使温体仁心存芥蒂，他的仕途凶多吉少。

据抱阳生《甲申朝事小纪》四编卷九&ldo;郑谦止始末&rdo;记载，郑鄤初次拜谒温体仁时，两人之间的一场交谈，已经伏下郑鄤日后悲剧性下场的伏笔：

温体仁试探性地提问：&ldo;南方清议如何？&rdo;

郑鄤毫无戒备地回答：&ldo;人云国家需才，而庙堂未见刚才。

&rdo;

温体仁说：&ldo;非不用才，天下无才可用。

&rdo;

郑鄤说：&ldo;用人则才出，不用则才伏。

方今防边荡寇最急，能如萧相国（按：指萧何）之识韩淮阴（按：指韩信），宗留守（按：指宗泽）之识岳忠武（按：指岳飞），何患不能成功？&rdo;

对于如此咄咄逼人的气势，温体仁极为反感，表面上致谢，暗中却在盘算：&ldo;彼锋芒如刃，必纠弹我，动摇我相位&rdo;，一定得设法剪除。

适逢此时温体仁先后排挤了阁僚何吾驺、文震孟，京都舆论哄然不平，一向敢于直谏

又不甘寂寞的郑鄤也发表了愤激言论，非议温体仁。

温体仁获悉后，决定上疏纠弹郑鄤，

并借题发挥整一下他的好友文震孟、黄道周。

据陆世仪《复社纪略》及文秉《烈皇小识》记载，崇祯八年十一月，温体仁决计黜除

郑鄤，化钱从吴宗达处购得道听途说的揭发材料－－骇人听闻的所谓&ldo;杖母蒸妻&lso;&rso;的不实之词，丐成纠弹郑鄤的奏疏。

然后拿了这份奏稿去找曾经向他推荐郑鄤的钱士升，对他说：&rdo;今为郑某事具鹛，当与老先生同题。

&ldo;钱士升欣然答应，等到看完疏文，才知道里面写的是郑鄤&rdo;杖母蒸妻&ldo;的事情，立即面红耳赤，双腿颤抖，张口结舌说不出话来。

温体仁冷笑道：&rdo;固知老先生不愿题也。

&ldo;遂单独具名呈送皇上。

当时皇帝正以孝悌风励天下，得知内阁首辅控告郑鄤如此不孝不悌，勃然震怒，下令将他逮入刑部狱中严加审讯。

刑部尚书冯英初审后，向皇上报告：&rdo;郑鄤假箕仙幻术，蛊惑伊父郑振先无端披剃，义假箕仙批词，迫其父以杖母。