崇祯皇帝获悉此事后，大为震惊，考虑到毛文龙既然已死，目前正要倚重袁崇焕收复辽东，不得不改变先前对毛文龙的优容态度，支持袁崇焕，表示&ldo;阃外原不中制，不必引罪&rdo;。

这一事件的处置，对于崇祯皇帝而言，实在是不得已而为之。

因为他已把辽事全盘托付给了袁崇焕，由他全权处理，将在外君命有所不受，处夕e毛文龙自然难以问罪。

他只要求袁崇焕能实现五年复辽的诺言，在此前提下，一切都可以听任他便宜行事。

对于袁崇焕而言，杀毛文龙人错特错，于己于国都无好处。

于己，他在杀毛文龙时曾发誓：我若不能恢复辽东，愿齿尚方（剑）以谢尔；在给皇帝的奏疏中也说：臣五年不能平奴，求皇上亦以诛文龙者诛臣。

但是恢复辽东的军事行动尚未开始，先自同室操戈，削去自己的右臂，无异于把自己逼上了绝路，如果不能实观五年复辽的承诺，那么只有一死。

一语成谶，不幸而被言中，袁崇焕果然比毛文龙死得更惨

（将另文细表）。

正如谈迁在《国榷》中所说：&ldo;（袁氏）杀岛帅（毛文龙）适所以自杀也&rdo;。

于国，临敌斩帅乃兵家大忌，内部窝里斗的结果，使皇太：吸发兵南下没有了后顾之忧，不费一兵一卒而坐收渔翁之利。

毛文龙所说&ldo;将江山而快私忿，操戈矛于同室&rdo;并非夸张之词。

夏允彝《幸存录》的评论还是比较客观公止的：&ldo;（毛）文龙当辽事破坏；之后，从岛中收召辽人，牵制金、复、海、盖（按：指辽东半岛金州、复州；海州、盖州四卫之地），时时袭东，有所斩获，颇有功。

但渐骄恣，所上事多浮夸，索饷又过多，朝论多疑而厌之者，以其握重兵，又居海岛中，莫能难也。

&rdo;袁崇焕杀毛文龙反映了朝论的这种倾向。

但是从全局看，毛文龙作为平辽将军的存在，毫无疑问对后金（清）是一大威慑力量，是他们南‐卜进关骚扰的后顾主忧，有着不可忽视的战略意义。

对此，袁崇焕也不否认：&ldo;东江一镇，乃牵制之必资也。

&rdo;

尽管皇帝对袁崇焕杀毛文龙不予追究，但是朝廷有关方面官员还是进行了委婉言批评。

《明清史料》所收的两个题本最能说明问题。

负责监察兵部的兵科都给事中张鹏云说：毛文龙所控制的旅顺附近的金复海盖四州，实为要地，与宁远可以呼吸相通，倘驻兵于此，平时可以壮声势，战时可以探虎穴。

兵科给事中宋呜梧也说：兵法讲究犄角以牵制，多方以误之，当后金全师出击时，如能分疲其势，就能使其攻捣徒劳。

如能掌控复州盖州以及东江一带，以窥辽沈，尤为全策。

都旁敲侧击地肯定了毛文龙及其辖地在牵制后金（清）军队方面的战略作用。

止因为如此，后金（清）方面早就把毛文龙视力眼中钉，对他软硬兼施，但征讨与招降都没有收到什么效果。