另一方面，正如著名藏学家和民族学家牙含章先生所说，&ldo;如从政治方面来说，当然达赖方面在西藏地区政治上居于主要地位，占绝对优势。

但是清朝中央政权把达赖和班禅置于平等地位，都归皇帝直接领导，都受清朝政府的册封，都归驻藏大臣监督，重大问题都要请示皇帝批准，重要官员都由皇帝任命。

所以在清朝统治时期，达赖喇嘛和班禅，都是受中央政权管辖的，他们两者之间，互无隶属关系，是完全平等的。

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班禅这一称呼的来历有好几种不同的说法。

后藏日喀则的札什伦布寺是历代班禅居住的大寺，相传该寺的住持&ldo;池巴&rdo;就含有班禅这一意思。

&ldo;班&rdo;是梵文班智达的缩写，意为学者，&ldo;禅&rdo;是藏语&ldo;大&rdo;的意思，藏族历史上有几位著名的学者的名字都叫过萨迦班钦（禅）、雅德班钦（禅），这是藏族人对那些精通梵语和藏语、学识渊博的学者的称呼。

另一种说法是，1645年，四世班禅和五世达赖喇嘛请固始汗推翻噶玛政权后，固始汗仿照俺答汗赠给三世达赖喇嘛索南嘉措&ldo;达赖喇嘛&rdo;尊号的前例，给四世班禅赠送了&ldo;班禅博克多&rdo;的尊号。

&ldo;博克多&rdo;是蒙语，是蒙古人对睿智英武人物的尊称。

至此，西藏才有了&ldo;班掸&rdo;这一称呼。

最后一种观点认为，&ldo;班禅&rdo;的称谓是从五世班禅罗桑益西开始的，这是因为五世班禅是遵照五世达赖喇嘛的指示，经过降神、算卜、寻访等手续后才认定的，并且在1713年由清圣祖康熙册封他为&ldo;班禅额尔德尼&rdo;后，&ldo;班禅额尔德尼&rdo;一词才在藏族历史上出现。

从班禅转世系统的形成过程看，一世至四世还只是过渡阶段，从五世班禅开始才正式形成。

二世班禅索南确朗，生于1439年，年幼时在拉萨著名的甘丹寺出家，精通显宗和密宗，在寺院有很高的声誉。

索南确朗自幼身体瘦弱，当他到甘丹寺出家时，当时的甘丹寺住持问他叫什么名字时，他回答说：&ldo;小牛。

小牛长大成大牛&rdo;。

在持心想这是位有善缘的弟子，就取名叫索南确朗。

由于他学识渊博，甘丹寺上下都认为他是一世班禅克珠杰的&ldo;转世灵童&rdo;。

二世班禅享年65岁，传说他圆寂时，乐声响彻天空，小雨绵绵。

三世班禅罗桑丹珠，1505年生于后藏雅鲁藏布江之滨的温萨。

出生时，即会说&ldo;可怜的众生，噣嘛呢叭咪哞（六字真言）&rdo;等语。

他母亲听后惊奇不已，觉得不吉祥，就用一块脏毡盖在他的头部上。

后来三世班禅对人说：&ldo;就因为母亲的这种做法，使我一开始和同龄儿童讲话时，就言钝唇笨，谈吐困难&rdo;。

三世班禅自小喜欢幽静，喜欢长时间地凝视释迦牟尼和宗喀巴大师的佛像，相传他8岁时曾梦见一轮明月从金山升起，自己身着白衣，佩带珍宝饰品，手持铃杵居于月中，铃声响遍世间。

三世班禅11岁出家，苦修集密灌项等密法。

17岁染上痘病。