以毛贵为首的红巾军在山东等地，甚得民心，有的人把得到的衣粮分与贫民，凡无罪而被掠者一律放还。

&ldo;又于莱州立三百六十屯田，每屯相去三十里；造大车百辆以挽运粮储，官、民田只十取其二分&rdo;[20]。

又立&ldo;宾兴院&rdo;罗致人才。

为了解除红巾军的威胁，元朝政府曾下令要把汉人一概捕杀，并把&ldo;诸蒙古、色目因迁谪在外者皆召还京师&rdo;。

后来看到汉族地主也敌视红巾军，就宣告免除南人、北人的界限，凡起兵镇压红巾军的人都给以万户、千户、百户的爵赏。

元朝政府还赐方国珍、张士诚龙衣、御酒，给以官号，收买他们为蒙古统治者效力。

方国珍、张士诚接受了元朝的官号，转而与红巾军为敌。

至正十二年（1352年），察罕帖木儿、李思齐等起兵进攻红巾军，&ldo;所在义士俱将兵来会&rdo;。

同年，答失八都鲁也&ldo;招募襄阳官吏及土豪避兵者&rdo;，北上袭击毫州[21]。

答失八都鲁的军队于至正十六年（1356年）被刘福通歼灭，但察罕帖木儿得到元朝统治者的大力支持，军容日盛。

至正十八年（1358年），察罕帖木儿以兵分镇关陕、荆州、河洛、江淮四地，又以重兵屯太行山，成为红巾军最凶恶的敌人。

汉族地主阶级在农民起义的过程中，一部分人始终对蒙元效忠，坚决与农民为敌。

他们要&ldo;竭忠以报国家&rdo;[22]。

另一部分人则不愿做蒙古人的奴才，结寨自保，观变待机。

但这些人实际上与元统治者也是站在一起的。

也有一小部分人参加了农民军，这是由于汉族地主与蒙古统治者之间还存在着尖锐民族矛盾，有的人则是迫于农民军的威力。

徐寿辉领导的红中军经过多次血战，许多地区得而复失，彭莹玉也在战斗中牺牲[23]。

以后徐寿辉又派部将明玉珍攻取四川，四川和云南一部分地区也被红巾军控制。

至正二十年（1360年），徐寿辉为其部将陈友谅所杀，陈友谅即位做了皇帝，国号大汉。

明玉珍不服陈友谅的领导，不久也在四川重庆自立，国号大夏。

刘福通领导的红巾军逐渐处于不利的形势。

北伐的三路大军在事前并无精密的布置，军令既不统一，彼此间也缺乏联系。

关先生、破头潘和李喜喜的军队始终在各地流动作战，没有巩固的根据地，前方胜利，后方又遭到敌人的攻击。

至正十九年（1359年），察罕帖木儿攻占汴梁，韩林儿、刘福通撤兵走安丰。

这时，驻守山东的毛贵被部属赵君用所杀，察罕帖木儿乘机进迫山东，山东各城亦被察罕帖木儿占领。

山东一失，安丰的屏藩就被撤除了。

至正二十三年（1363年），张士诚围安丰，城破，刘福通遇难牺牲。

刘福通、韩林儿领导的红巾军虽然失败，但是在反元斗争中，前后十三年，大小数百战，给予蒙古贵族和汉族官僚地主致命的打击，已从根本上摧毁了蒙元王朝的统治。