宋朝奸臣贾似道被迫出兵应战，但很快战败。

至元十三年（1276），临安陷落，宋恭帝被俘。

之后，宋朝大臣文天祥与张世杰、陆秀夫等继续在东南沿海坚持抗元，拥立益王赵昰为帝。

赵昰死后，

又拥立卫王赵昺，继续抗战。

至元十五年（1278），文天祥兵败被俘，被囚于大都三年之久，拒绝了元朝的诱降，后从容就义。

至元十六年（1279），元将张弘范指挥元军在崖山消灭了宋朝最后的抵抗

势力，陆秀夫背着8岁的幼帝赵昺投海殉国，宋朝灭亡。

之后，元军曾进攻过周边一些地区，如安南、占城、爪哇和日本等，其中以试图入侵日本的战争最为著名。

元朝于1274年和1281年两次入侵日本，

但皆因内部不和、不习水战，以及遭遇台风等而遭致惨败。

（有学者认为：为忽必烈建造战舰的高丽人有意建造和设计质量极其低劣的船是导致忽必烈的蒙古舰队葬身鱼腹的主要原因）。

灭宋之后

元灭宋后，统治阶层出现了以许衡为首的儒臣派与以阿合马为首的理财派官员之争。

由于元廷需要赏赐大量财宝予各封王，加上开支繁重，所以财政日渐紧张。

以汉人及汉化的蒙古人为主的儒臣派

官员认为元朝应该节省经费、减免税收。

反之以色目人为主的理财派官员认为，南人藏有大量财物，应没收以解决朝廷的财政问题。

于是这个问题在元朝廷中没有停止。

元薛禅汗信任色目官员阿合

马，设立尚书省解决财政问题。

而儒臣则以受汉化更深的太子真金为核心形成一派，与阿合马抗衡。

结果阿合马被刺杀，而真金也于其后得病而死。

元世祖仍然先后任用汉人卢世荣、西藏人桑哥等理财

派官员以之来解决朝廷的财政问题。

至元三十一年（1294）元薛禅汗驾崩。

由于太子真金早死，帝位由各方争夺。

最后，群臣在真金的长子晋王甘麻剌及三子铁穆尔之间选择，由于铁穆尔受元薛禅

汗下赐皇太子宝及镇守和林。

故晋王甘麻剌退让，铁穆尔即位为元完泽笃汗。

元完泽笃汗在位期间基本维持守成局面，并下令停止对外战争，罢征日本、安南，专力整顿国内军政，减免江南部分赋

税。

他执政末年还成功与长期敌对的窝阔台汗国和察合台汗国讲和，结束了西北的动乱局面。

元朝中后期

大德十一年（1307），完泽笃汗死，前太子真金之孙海山即位于元上都，是为元曲律汗。

并立其弟爱育黎拔力八达为皇太子，约定兄终弟及，同时又约定爱育黎拔力八达死后，帝位复归武宗之子和